醫用膜分離制氧系統的注冊證辦理涉及多個步驟，具體如下：

1. 準備申請文件：收集并準備與醫用膜分離制氧系統相關的文件和資料，包括產品技術說明、性能數據、生產工藝流程、質量管理體系文件、臨床試驗數據等。

2. 選擇注冊機構：根據相關法規和標準，選擇合適的注冊機構進行申請。這可能涉及中國國家藥品監督管理局（NMPA）或其他相關機構。

3. 提交申請：將準備好的申請文件提交給注冊機構。確保文件完整、準確，并符合相關要求。

4. 技術評估：注冊機構將對申請進行技術評估，包括對產品技術規格、工作原理、使用方法等的審查。確保產品符合相關標準和規定。

5. 臨床試驗與評估：根據需要，進行臨床試驗以評估醫用膜分離制氧系統的安全性和有效性。提交臨床試驗報告和其他相關數據給注冊機構進行評估。

6. 生產質量檢查：注冊機構可能還會對生產設施和過程進行現場檢查，以確保生產過程符合相關法規和質量管理體系的要求。

7. 頒發注冊證：如果醫用膜分離制氧系統通過了技術評估、臨床試驗和生產質量檢查，注冊機構將頒發相應的注冊證，允許產品在指定區域內合法銷售和使用。