血液透析器注冊證的辦理流程如下：

1. 收集和準備相關申請材料：包括產品注冊申請表、產品說明書、技術文件、質量管理體系文件、臨床試驗數據等。

2. 聯系當地的醫療器械監管機構，了解具體的辦理流程、所需材料和要求。

3. 將完整的申請材料遞交給當地的醫療器械監管機構。

4. 監管機構會對申請材料進行審核，包括材料的完整性、真實性、合規性等。

5. 如果需要進行臨床試驗，監管機構會安排并監督臨床試驗的執行。

6. 如果審核通過，監管機構會頒發一次性使用血液透析濾過器的注冊證，并標明注冊號、有效期等信息。