立式蒸汽滅菌器的生產許可證辦理流程如下：

1. 準備申請資料：根據相關法規和標準，準備申請所需的所有資料，包括企業資質證明、產品技術文件、生產設備清單、工藝流程圖、質量管理體系文件等。確保資料的完整性和準確性。

2. 提交申請：將準備好的申請資料提交給相應的醫療器械監管機構，如國家藥品監督管理局或類似的機構。同時，需要支付相應的申請費用。

3. 審查與批準：監管機構將對申請資料進行審查，并對生產現場進行實地考核，以確保企業的生產條件和質量管理體系符合要求。

4. 制證與發證：如果通過審查和考核，監管機構將頒發生產許可證，允許企業生產立式蒸汽滅菌器。