紅外治療儀的注冊證辦理步驟如下：

1. 確定產品分類：根據產品特性和風險程度，確定紅外治療儀的分類，通常醫療器械分為三類，其中一類醫療器械風險程度較低，實行常規管理可以保證其安全、有效；二類醫療器械具有中度風險，需要嚴格控制管理以保證其安全、有效；三類醫療器械風險程度較高，需要采取特別措施嚴格控制管理以保證其安全、有效。

2. 準備注冊資料：根據產品分類和相關法規要求，準備注冊所需的各種資料，包括產品技術要求、質量管理體系文件、生產工藝流程圖、安全性能測試報告等。這些資料需要完整、準確，并且需要經過翻譯和公證等程序。

3. 提交注冊申請：將準備好的注冊資料提交給所在地省級以上食品藥品監督管理部門進行審核。申請時需要提交相關表格和證明文件，并支付相應的注冊費用。

4. 審核與現場檢查：監管部門會對提交的注冊資料進行審核，并可能進行現場檢查，以確保產品符合相關法規和標準的要求。審核和現場檢查的重點是產品的安全性、有效性和質量可控性。

5. 頒發注冊證：如果審核和現場檢查通過，監管部門會頒發醫療器械注冊證，允許產品在市場上銷售。注冊證的有效期通常為五年，到期需要進行延續注冊。

6. 生產與經營許可：在獲得注冊證后，企業還需要根據相關法規申請生產許可和經營許可，以確保產品的生產和經營符合監管要求。