自動核酸分子雜交儀屬于醫療器械，需要按照相關規定進行注冊證辦理。以下是注冊證辦理的一般流程：

1. 準備申請資料：根據相關規定，準備完整的申請資料，包括產品技術文檔、質量管理體系文件、產品測試報告等。確保申請資料符合相關規定。

2. 提交申請：將完整的申請資料提交給相關機構。確保申請材料的完整性和準確性，按照規定的方式和格式進行遞交。

3. 技術審評：相關機構將對申請資料進行技術審評，包括對產品的安全性、有效性、合規性等方面進行評估。審評過程中可能需要補充材料或進行進一步測試。

4. 現場檢查：在技術審評通過后，相關機構將對生產現場進行檢查，以確保生產條件、設施和質量管理符合相關要求。

5. 頒發注冊證：如果現場檢查和技術審評均通過，相關機構將頒發醫療器械注冊證，允許產品在目標市場銷售。注冊證的有效期可能有所不同，具體取決于不同國家和地區的規定。