腸道病毒71型和柯薩奇病毒A16型核酸檢測試劑盒生產許可證的辦理流程通常涉及以下步驟：

1. 了解相關法規和要求：

2. 深入研究并了解目標國家或地區關于醫療器械生產的法規和標準要求，特別是關于核酸檢測試劑盒的相關規定。

3. 準備申請材料：

4. 根據目標國家或地區的法規要求，準備完整的申請材料。這些材料可能包括公司基本信息、生產工藝流程、質量控制體系、產品技術規格、設備清單、原材料供應商信息等。

5. 同時，確保準備的臨床試驗數據、性能測試報告等相關文件符合目標國家或地區的標準和要求。

6. 選擇認證機構或監管機構：

7. 根據目標國家或地區的規定，選擇合適的認證機構或監管機構進行申請。這些機構通常負責審核和評估申請材料，并決定是否頒發生產許可證。

8. 提交申請：

9. 將準備好的申請材料提交給認證機構或監管機構。在提交申請時，請確保所有材料齊全、準確，并符合相關法規的要求。

10. 接受審核和評估：

11. 認證機構或監管機構將對提交的申請材料進行審核和評估。這可能包括對公司生產設施、質量管理體系、產品技術規格等方面的現場檢查或遠程審核。

12. 獲得生產許可證：

13. 如果審核和評估結果符合要求，認證機構或監管機構將頒發腸道病毒71型和柯薩奇病毒A16型核酸檢測試劑盒的生產許可證。

14. 遵守后續監管要求：

15. 在獲得生產許可證后，需要遵守目標國家或地區的后續監管要求，如定期報告、接受監督檢查、處理不良事件等。