腸道病毒通用型、柯薩奇病毒A16型（CA16）、腸道病毒71型（EV71）核酸檢測試劑盒的出口認證辦理是一個復雜且關鍵的過程，以下是詳細的辦理流程和注意事項：

首先，需要深入研究目標市場（如歐盟、美國、日本等）的醫療器械和體外診斷試劑（IVD）的進口法規、注冊要求、認證標準等。這些法規通常包括產品的注冊要求、技術文件要求、質量管理體系要求、臨床試驗要求等。由于不同國家的法規存在差異，因此需要特別關注目標市場的具體要求，例如：

根據目標市場的法規要求，準備腸道病毒通用型、柯薩奇病毒A16型、腸道病毒71型核酸檢測試劑盒的技術文件。這些文件通常包括：

根據目標市場的規定，選擇一家具備相應資質和經驗的認證機構進行產品認證。這個機構應該能夠對你的產品進行評估和審核。在選擇認證機構時，可以參考行業內的推薦或排名，以及機構的歷史記錄和信譽度。例如：

將準備好的技術文件和其他必要的申請材料（如企業資質證明、質量管理體系文件等）提交給認證機構或目標市場的醫療器械監管機構。填寫并提交相應的申請表格，支付申請費用。認證機構或監管機構將對提交的申請材料進行審核和評估，包括技術指標的符合性、安全性、有效性等方面。

根據需要，認證機構可能對企業的生產現場進行現場檢查，以核實生產條件、質量管理體系等是否符合要求。如果產品需要進行現場檢查或樣品測試，認證機構將提前通知并提供詳細的指導。

在審核過程中，如果發現任何問題或需要補充材料，認證機構將及時與申請人溝通并要求其進行整改或補充。

如果產品符合目標市場的法規要求和技術標準，認證機構將頒發相應的認證證書（如CE證書、FDA認證等），允許腸道病毒通用型、柯薩奇病毒A16型、腸道病毒71型核酸檢測試劑盒在目標市場銷售和使用。

獲得認證后，企業需要持續遵守相關法規和標準要求，并接受監管機構的持續監管和檢查。根據法規要求，定期提交產品更新報告、接受監督檢查等。